分子生物学实验中心是国家重大科学工程“中国西南野生生物种质资源库”的重要组成部分，具有完备的分子生物学实验装备和实验技术支撑管理人员。目前实验中心的5名技术管理人员管辖着200多台／套通用分子生物学实验设备和包括DNA测序仪、多重基因分析系统在内的14台／套大型仪器设备。实验中心在继承传统的以DNA测序为主要实验手段的分子植物系统学及地理学和以各类分子标记（ISSR、SSR等）为主要实验研究手段的遗传多样性研究的基础上，正在发展基因组学及功能基因的实验研究手段。实验中心现有10余个研究组的70 名研究人员开展实验研究工作，已形成良好的实验技术交流氛围。本实验中心定位为公共、开放实验室，欢迎有实验要求的研究人员到实验中心开展相关实验研究工作。