光柄菇科（Pluteaceae）真菌是一类广泛分布于全球森林生态系统中的腐生担子菌，对有机物分解、物质循环与能量流动发挥重要生态功能。物种是重建演化历史、评估全球生物多样性分布格局的最基本的核心单元。准确的物种界定是系统发育、演化、生物地理研究和生物多样性保护的基础。然而，由于该类群的进化历史复杂，杂交与不完全谱系分选并存，物种界定困难，系统发育关系不清。为解决该科物种界定难题，揭示该类真菌的物种多样性、分布格局及其起源演化规律，中国科学院昆明植物研究所真菌多样性和创新进化专题组在标本多年积累基础上，借助国内外标本馆际借阅增补研究样品，基于广泛取样，对该科开展了系统发育与物种界定研究。

该研究基于121个基因组浅层测序数据（涵盖光柄菇亚目98个具有代表性的物种），筛选出672个单拷贝直系同源基因，根据Phytop量化不完全谱系分选及杂交信号等系统发育冲突检验方法，发现该科在支系分化的早期就发生过不完全谱系分选和杂交事件。随后，该研究又以物种间具有高度形态相似性的光柄菇组（Pluteus sect. Pluteus）为例，开展系统发育网络分析，发现该组存在复杂的基因渐渗/杂交事件，这是导致该组内系统发育严重冲突的原因。基于系统发育基因组学与形态学证据，该研究修订了该科的分类框架，证实了该科包括2个属，即光柄菇属（Pluteus）和托光柄菇属（Volvopluteus）；将光柄菇属划分为2个亚属、4个组，其中粉霜皮层组sect. Pruinoderma为该研究建立的新组。

该研究基于多物种溯祖模型的贝叶斯系统发育与系统地理学方法（BPP），结合形态与生态证据，在“分子－形态－生态”界定真菌物种的基础上，提出将BPP支持率>0.995作为光柄菇科物种独立性检验标准，以避免物种过度细分。使用上述分类系统和分类指标，结合前人分类研究成果，作者对中国光柄菇科真菌开展了系统的研究，共核实和记载82个物种，其中7个物种为该研究发表的新物种，并编制了中国该科分种检索表。

该研究发现物种杂交、不完全谱系分选等事件是造成分亚属、分组和物种界定困难的原因，为深入认识全球光柄菇科的物种多样性、起源演化和分布格局提供了稳健的系统学框架，也为该科物种精准界定提供了科学标准。近日，成果在国际学术期刊Mycosphere以Phylogeny and species delimitation of Pluteaceae (Agaricales) with documentation on the species from China为题发表。昆明植物研究所博士研究生陈璇为该论文第一作者，杨祝良研究员为通讯作者。

该研究得到了国家自然科学基金委员会－云南省人民政府联合基金项目（U2202205）和云南省“兴滇英才支持计划”科技领军人才项目（202305AB350004）等项目的资助。

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图1 我国光柄菇科代表物种的子实体照片。(a) 橘红光柄菇Pluteus aurantiorugosus; (b) 灰光柄菇P. cervinus; (c) 金盾光柄菇P. chrysaegis; (d) 本乡光柄菇P. hongoi; (e) 棕灰光柄菇P. poliocnemis; (f) 暗紫光柄菇P. purpureofuscus; (g) 网盖光柄菇P. thomsonii; (h) 乌苏里光柄菇P. ussuriensis; (i) 多色光柄菇P. variabilicolor; (j) 黏盖托光柄菇Volvopluteus gloiocephalus; (k) 高原托光柄菇Vp. platensis; (l) 云南托光柄菇Vp. yunnanensis

图2  基于672个单拷贝直系同源基因序列使用不同方法构建的光柄菇亚目系统发育框架，图为串联树（左）与溯祖树（右）的比较。未标注数值的节点表示支持率为100%（UFBS = 100，LPP = 1.00）。

图3  基于 672 个单拷贝直系同源基因由 ASTRAL 推断的光柄菇亚目物种树，叠加 PhyParts和QuartetScores以显示基因树一致性或冲突式样。子实体照片展示各谱系外形特征，蓝色线描图示可能的共衍征。