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世界首个普通野生稻全基因组框架图谱完成
来源:云南日报     作者:熊燕     2010-09-02     浏览次数:

中国科学院昆明植物研究所日前宣布,由该所高立志研究员带领的植物种质资源、基因组学与生物信息学团队,历时一年,完成了普通野生稻全基因组从头测序的框架图。这是我国科学家自主完成的第一个野生稻全基因组测序计划,也是世界上第一个完成的高杂合度野生稻全基因组框架图谱。

水稻全基因组的序列分析,是研究水稻遗传变异、发育与进化的基础,特别是培育高产、优质、美味的优良品种的基础。普通野生稻是亚洲栽培稻的公认祖先种,蕴藏着许多我们尚未认识与利用的优异基因。然而,它又是中国的二级保护植物,在我国三种野生稻中濒危状况最为严重。由于野生稻与栽培稻有着密切的亲缘关系,迄今水稻常规育种取得的大多数突破无不与发掘利用该种野生稻的优异基因相关。当年袁隆平等就是利用海南岛的一株雄性不育普通野生稻(野败)中的细胞质雄性不育基因,育成了闻名中外的杂交水稻。此前,粳稻基因组的精细图谱已经获得,籼稻基因组的框架图谱也已在我国科学家攻关下绘制成功。

在云南省自然科学基金重点项目、云南省高端科技人才项目、中国科学院“百人计划”海外杰出人才择优支持项目和中科院方向性重点项目的大力支持下,项目组自2009年开始了对普通野生稻全基因组框架图谱的攻关。依托建立于植物所内的中国西南野生生物种质资源库先进的基因组学与生物信息学平台,项目组运用新手段和新技术,历时1年,完成了普通野生稻基因组高覆盖的序列测定、拼接和组装工作,并最终获得普通野生稻全基因组从头测序的框架图。目前,项目组正加紧绘制普通野生稻的基因组精细图谱。

我省是亚洲栽培稻的遗传多样性中心之一,普通野生稻全基因组框架图谱的获得以及精细图谱的进一步绘制,不仅会大大促进云南野生稻资源的研究与发掘利用,同时对奠定我国野生稻种质资源的研究、利用和保护的雄厚科学基础具有非常重要的意义。

■新闻助读

基因与基因组图谱

基因是指携带有遗传信息的DNA序列,是控制生物性状的基本遗传单位。基因组图谱是指展示一种生物全基因组结构的图谱,简单地说,就是将基因在染色体上的分布状态、排列顺序等综合在一起而绘成的图谱。建立高等生物详尽的基因组图谱是遗传学家们研究的目标,也是基因组研究的一项重要内容。人们可以通过基因组图谱明确染色体上基因间的距离及它们之间的相互关系。基因组图谱可以用于培育优良的动植物品种,提高其产量、抗病性等。人类基因组图谱更是有可能大幅推进先天疾病、遗传疾病的研究和治疗。

来源:http://yn.yunnan.cn/html/2010-09/02/content_1329917.htm


 
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